Dalam proses biologis, terjadi dekomposisi melalui aktivitas bakteri anaerob dan fakultatif anaerob yang memakan zat-zat organik alam sludge dan scum. Hasilnya selain terbentuknya fuel dan zat cair lainnya, adalah juga pengurangan quantity sludge, sehingga memungkinkan septic tank tidak cepat penuh.